青木瓜是有籽的，它就在果實裏面，數量是比較多的，未成熟的時候是白色的，比較柔軟，成熟之後是黑褐色的，形狀是不規則的，比較堅硬。青木瓜籽一般是不建議吃的，一般人吃木瓜，都是把裏面的籽去除之後再食用的，很少有直接吃青木瓜籽的，口感也不好。
青木瓜種子在播種前可以用適量濃度蘇打溶液浸泡6～8小時，浸後撈起瀝乾摻拌沙子，然後將其撒播於苗牀中，覆蓋一層薄土後再蓋層稻草，保持溼潤，40～50天即可出苗。
