香水百合可能會感染的病害較多，有灰黴病、根腐病、立枯病等，若是第一種灰黴病，要合理施肥，噴施一些藥物，比如甲霜靈等。若是根腐病，需要切除腐爛部分，對土壤消毒。若是立枯病，不僅要對土壤消毒，還需噴百菌清。蟲害有蚜蟲、蠐螬、地老虎等，最有效的方法就是噴施藥劑。
