危害牡丹的疾病很多，其中紅斑病的情況最爲嚴重，患病後葉子會出現斑點，之後連成片，影響植株開花，還可能導致其枯萎，通常要用多菌靈或百菌清防治。它的常見害蟲是蠐螬，也就是金龜子的幼蟲，主要危害植株根莖，需要用辛硫磷溶液灌根將其消滅。
