土壤中的生物是土壤肥力的核心，它間接地或直接地參與土壤中幾乎所有的物理的、化學的、生物學的反應，對土壤肥力起着非常重要的作用。
土壤中的微生物種類繁多，主要有細菌、放線菌、真菌、藻類和原生動物等五大類羣。其中細菌、放線菌、真菌的個體雖小，但它繁殖快，數量大，通常每克土中有幾十億個，是土壤微生物的主要部分。
