花菖蒲是有種子的,它的種子爲扁平狀、半圓形,呈棕褐色。莢果在生長成熟之後,會從頂端向下裂開到1/3處,在成熟開裂之後將其打開就可以獲得種子了。果期是在秋季的8-9月份,種子會在1月份中旬左右成熟,在採收種子之後就可以進行播種,或者是低溫冷藏到第二年播種。