檸檬樹盆栽澆灌雨水或者河水最好，裡面含礦物質，利於它的生長。不過若是條件不允許，澆灌晾晒後的自來水就行，一定要晾晒，將裡面的氯氣揮發掉才可使用。另外，還要注意澆水次數。春秋季要保證盆土溼潤，三天澆一次。夏季高溫，勤噴水噴水。冬季土壤不幹就不澆，避免凍傷。
